在第41個千年裡，那些被孤立於一個星球上，生活在極端環境下的原處人類必須通過進化或變異來適應環境·，而他們的後代便演化成亞人類。這個術語來源於「走上歧途的人類」，「不正常的人類」，或者，不帶偏見的說，來自於拉丁術語abhumanis，」來自人類「。在帝國里，基因突變和精神腐蝕往往被視為相互聯繫的，對待亞人類的態度在帝國征服里往往有很大的爭議。在第30個千年，人皇統治的開明時代，即便是顯著異化的亞人類，比如野獸人，也能在帝國部隊里服役。在荷魯斯反叛，皇帝坐上了黃金王座進入了停滯狀態之後，只有變異程度較低的亞人類才能享有帝國公民權，比如歐格林猿人和萊特林鼠人。但是，在帝國的任何一個角落，他們依然不被清教派的審判官及帝國信條的忠實信徒所信任。在第41個恰年的末期，泰拉征服認同過得73種不同的亞人族群里有56個族群都宣布滅絕，還有十二各族群因為缺乏和帝國代表的溝通而處於滅絕的邊緣。如下詳述的是一些帝國境內最有特色的亞人類直系

領航者

領航者是一中被帝國政府特許存在的變種人，他們基因普里特有的領航者基因起源於技術的黑暗年代。所有的領航者都的額頭上都長有第三隻眼，通常被稱作亞空間眼，可以保證他們註釋亞空間時不會失去理智。利用星炬發出的」靈能光芒「作為穩定的參考坐標點，領航者利用他們第三隻眼的力量引導人類非常穿越混沌的洪流。他們感知混沌浪潮的能力被認為是一種靈能，但靈能者從來不能掌握任何一種超出星際導航之外的任何其他靈能。由於導航者基因是時代遺傳，而不是隨意產生的，皇帝本人在第30個千年的統一戰爭時期起早了一份要求包容導航者的招數，因為領航者以及其背後強大的領航貴族門閥是帝國商業和防務得以存續關鍵。領航者全都住在皇帝特許的泰拉世界城裡。領航者門閥的內政以其極端勾心鬥角和爾虞我詐而聞名。

阿福瑞爾支系

阿福瑞爾支系士兵是機械神教發起的一場基因改造戰士實驗的產品，對他們我們知道的很少。只知道機械神教想提取過去人類歷史上英雄們的基因特性，並重塑這些讓他們得以偉大的基因。這個實驗本來計劃著創造完美的士兵，結果卻是徹底的失敗。阿福瑞爾戰士，由於不明的原因，成為了人類品種中運氣最糟的一個群體，以至於有些機械神教徒相信他們的基因構成可能與亞空間產生了互動，改變了幾率的法則。阿福瑞爾人都有白化病，他們有雪花般的皮膚，慘白的頭髮和無色的眼睛。

野獸人

野獸人（variatus在拉丁語里是改變的陽性動詞變位）是由蹄子有角，多毛，長得像山羊或岩羊的亞人類。他們過去曾在帝國部隊中服役，在那裡他們充分利用自身嗜血的特性為皇帝而戰，以補償自己生為變異人的原罪。他們由一位叫守群頭領的野獸人領導。現在，」純血「的野獸人已經在人類的隊伍中看不到了，因為顯著的突變者只為混沌服務。毫無疑問，清教派審判官說服內政部野獸人不可能在沒有混沌力量的污染下產生如此劇烈的變異。相對於」純血「而言，作為炮灰和可消耗的突擊部隊，一些肢體變異程度不高的野獸人直系依然允許在帝**隊內服役。

歐格林猿人

這些愚笨的人類支系被稱為歐格林猿人（gigantus是拉丁語巨大的形容詞陽性變位，法國小說巨人傳的發育就是gargantuaandpantagruel）他們是在高重力，低氣溫的監獄星球上進化而來的，他們比其他亞人類更龐大，更愚蠢，但只要向他們傳授帝國國教他們便，毋庸置疑的終於帝國。猿人在帝國衛隊里充當突擊部隊，為了擔任這個角色，猿人經常配備撕裂搶。撕裂搶一樣非常簡單易用的武器，但是帝國治外的猿人可能連這麼簡單地東西都不會用。猿人經常會作為帝**官的保鏢。猿人有幽閉症，所以很難運輸。他們由具有代表性的」骨頭腦袋「軍官領導，這些猿人接受過一項叫做歐格林猿人生化神經強化手術（一般被稱為bone治療），可以把他們的智商拔高到接近正常人的水平。有的時候，如果時間緊迫，有的帝國指揮官沒有耐心教育新鮮出爐剛剛入伍的猿人士兵，就隨便給他們一個大棒子，告訴他們用這個砸向敵人就行了。

萊特林鼠人

萊特林鼠人是矮小，喧鬧，容易飢餓且極其好色的亞人類，他們一般在衛隊里最為狙擊手，這一點上他們很有天賦。萊特林也在帝國衛隊中擔任廚師，因為他們生活中為了填飽自己無底洞般的肚子必然會學會這一技巧。他們同時還有偷竊癖傾向，因為每當鼠人被編入一個派，連或軍團里時，政委那裡關於偷竊和非法賭博的報告就會顯著增加。其中一個被命名為過得鼠人世界是ornsworld，在哥特戰爭時期阿巴頓曾攻擊過那裡。和猿人一樣，鼠人是經過變異的人類分支，目的是為了適應地底隧道里的生活，因為地表環境惡劣。由於他們的體型，他們經常為主流人類士兵所嘲笑，但是有不止一名士兵被鼠人高超的射擊技巧所拯救。

太空矮人

太空矮人（rotundus拉丁語形容詞原型）來自距離銀河中心很近的高重力的礦業星球，導致他們矮小，肌肉發達且堅韌。他們的世界在叛教時代從帝國的版圖裡分裂了出去，但之後他們作為自治但高貴的世界回歸了帝國版圖。太空矮人是很有天分的工程師，而且以記仇不忘而得名，特別是對於獸人。在戰鬥中，他們駕駛戰鬥摩托，在超重型火炮（比如利維坦和巨像）的掩護下攻擊敵人。在41個千年裡他們被泰倫蟲族滅絕了。

腺體戰爭老兵

腺體戰爭老兵是為了抵禦泰倫蟲族對於高度污染的丹提斯三號行星的入侵而創造的。機械神教的技術牧師改良了羅斯托克第23帝國衛隊軍團的幾個團以使他們可以在這地獄般的條件下作戰。很多器官和分泌藥物的腺體被移植入他們的體內，以使得他們可以在不被裝備保護的情況下在丹妮斯坦存活。他們的戰鬥能力和身體的進攻性也通過基因改良得以增強。得益於他們在丹尼斯三號防守戰中的大量戰損，這個世界得以保存。只有三名腺體戰士存活著，他們被審判庭帶走用以研究和詢問。

夜居者

夜居者是生活在極度黑暗環境下的亞人類。其原因要麼是因為其恆星太暗，或是其衛星離主星太遠，或是行星自傳極慢，導致行星的一側總是在太陽背面。夜居者可能有比正常人類更大的眼睛，簡直電燈泡死的；其他人可能退化了實力，反而依靠增強其他感官來補償他們眼盲的問題。

其他亞人類

內政部所記錄的合法亞人類還記載了以下亞人類，但已經不能提供除了他們還存在之外的其他的相關的細節了。

特羅斯人（verdantus拉丁語里為綠色之意）是一個在沃丹特世界土生土長的亞人類，由於為了適應環境而過度特化，一直不能離開這個星期。帝國對他們幾乎一無所知。

長人（elongatus在拉丁語里是處於高處之意）-這些亞人類通過基因突變適應了低重力環境行星的生活，他們很高，修長，且消瘦。他們發現他們幾乎不可能在重力大於他們原初星球的其他環境下生存。

海人也是在科技的黑暗時代通過進化或是基因轉換適應了在海洋里生活的環境。這些可居住的世界幾乎完全被液態水覆蓋。他們有腮也有肺，手和腳上進化出了蹼。他們在這些海洋世界里很常見，但是其他地方人們對他們一無所知。

貓人（hirsutus在拉丁語是長毛的意思，喵~~~~!!!!)是卡洛斯·麥克奈爾世界的土著居民，他們的變異是由於適應環境的生物需求，科技的黑暗時代的基因改造還是之前的帝國操縱已經不得而知，但是帝國絕大多數地方對他們一無所知。貓人具有地球上貓科動物分割下來的基因組，，他們有很多貓科東都的特點，比如在全身有短毛覆蓋，貓科動物的長犬齒以及超越普通人類的敏捷和優雅。

尼安德人是海諾斯四號星球上原處人類的後代。他們適應了這裡高重力和寒冷的環境。比方說他們長出了沖毛和更加堅韌的骨骼和肌肉，但這也讓他們離開這個星球成了一件難事。為此，帝國絕大多數地區對他們一無所知。