袁崇煥取得寧遠大捷後，乘勝揮師北上，一舉收服錦州等城，捷報傳到北京，朝野一片歡騰。
1627年，皇太極繼位後，再次率大軍向寧遠、錦州發動進攻，袁崇煥率軍英勇抵抗，打得皇太極暈頭轉向，死傷慘重，大敗而歸，這次錦州、寧遠保衛戰，史稱「寧錦大捷」。
魏忠賢眼見關外局勢好轉，便開始排擠打擊袁崇煥，逼迫他辭職。袁崇煥萬般無奈,，只得請辭。魏忠賢立即安排他的親信王之臣任督師兼遼東巡撫駐守寧遠。
不久，明熹宗逝世，由他的弟弟朱由檢即位，即崇禎皇帝。崇禎一上位，即剷除了閹黨魏忠賢集團，在各大臣的提議下，重新啟用袁崇煥，任命他為兵部尚書兼右部都御使。袁崇煥奉命入部，崇禎召見他，他向崇禎表示：「以臣之力，御全遼有餘，調眾口不足，一出國門，便成萬里，忌能妒功，夫豈無人？即不以權力掣臣肘，亦能以謠言亂臣謀。」
崇禎忙站起來傾聽，並當即表示：「卿勿疑慮，朕自有主意！」並賜袁崇煥共進午餐。
崇禎即位後，袁崇煥為了達到五年收復遼寧的目的，親派使者出使後金，偵探後金國情，皇太極也派出使者與袁崇煥談判，希望和平解決爭端，前後共談了三年，因為皇太極的條件太苛刻，談判以失敗告終。
皇太極在軍事上進攻多次慘敗，談判又達不到目的，便想用離間計剷除袁崇煥。恰在此時，因為守將毛文龍不服袁崇煥管理，且性格驕橫，他怕在關鍵時刻無法調配，於是想除掉他。一次，袁崇煥召見毛文龍，見面後，毛文龍多次用語言衝撞他，袁崇煥大怒，命令將他斬首示眾。崇禎皇帝聽到消息後，大為震驚。
1629年10月，就在袁崇煥殺毛文龍三個月後，皇太極率領十萬大軍繞過袁崇煥的防區，借路蒙古，突襲北京。兵分兩路，一路攻入洪山，一路攻入大安口，長驅北京。想要誘使崇禎調回袁崇煥，然後設計除掉他。
崇禎見兵臨帝都，果然大驚，忙召袁崇煥回師北京。袁崇煥接到警報後，忙揮師入關，命令率教、祖大壽部先行，自己率全軍為後應。崇禎見救兵已到，大喜，忙獎賞三軍。
袁崇煥本應駐軍通州與北京之間，以阻清兵向北京進發，但他卻率軍抵達右安門，清軍也尾隨而至，兩軍對壘。這時，皇太極散播袁崇煥將清軍引入並準備結為「城下之盟」的謠言，一時之間，朝廷內外，謠言四起。袁崇煥到達右安門後，請求進城休息，崇禎多疑，拒絕了袁崇煥的請求。
兩軍在城外展開了激烈的戰鬥，袁崇煥披甲上陣督戰，從中午血戰到傍晚，終於將清軍擊退。袁崇煥預料清軍遠道奔襲，一定希望速戰速決，不想打持久戰。於是，故意按兵固守，計劃養足銳氣，拖耗清軍精力與糧草，待清軍後退時再行追擊。果然，清軍消耗不起，想快點結速戰爭，三番五次進行挑戰，袁崇煥就是堅壁固守，讓士兵用炮火回擊，不肯出營半步。一連數天，天天如此。
第五天，崇禎帝召見袁崇煥進京面見，袁崇煥一見崇禎，正要跪拜，沒想到崇禎臉色一變，大喝一聲拿下，早已埋伏在朝堂上的御林軍一擁而上，將袁崇煥綁了個嚴嚴實實。
原來，在袁崇煥在城外與清軍浴血奮戰的時候，魏忠賢的餘黨在崇禎面前誹謗袁崇煥，說是他將清軍引入北京，企圖以清軍威逼朝廷求和，將與其結「城下之盟」，崇禎將信將疑。這個消息傳到皇太極耳中之後，皇太極大喜，再施第二計，親筆寫兩封書信，派密探投進德勝門與永定門，正好被太監拾得，交給崇禎，崇禎一看，上面寫著袁督師麾下親啟，他拆開一看，只見內容字跡模糊，但議和的內容隱約可辨。他大吃一驚，但兩軍正在膠著狀態，雖然疑心重重，但在沒有更充足的證據下，也不能倉促作出決定。正在這時，被清軍擄去的楊太監突然回來，向崇禎報告，說偷聽到重要情報。原來，皇太極入關後，故意捕獲了兩名太監，由副將高鳴中、參軍鮑承先監守，皇太極授意兩人在關兩太監的地方故意議論「皇太極與袁崇煥有密約，很快就會簽和約」，並特意讓兩太監聽到，再設計讓楊太監逃出來。楊太監逃回宮裡後，隨即將聽到的話告訴崇禎，崇禎通過兩下里一對照，完全吻合，這時，閹黨王永光趁機再進讒言，崇禎便深信不疑了，他憤然說：「難怪他按兵不通，果真是要與清兵議和！」於是斷定袁崇煥「通敵」無疑，並以「議餉」之名誘捕袁崇煥，將他下獄。
總兵祖大壽聽說袁崇煥被捕的消息後大驚，恐受株連，便帶所部離京，撤回山海關，崇禎知道後害怕極了，忙讓袁崇煥寫信給祖大壽，袁崇煥在軍中威望極高，他雖因冤下獄，仍以大局為重，寫信勸祖大壽聽從皇帝命令。祖大壽將袁崇煥的信在軍中朗讀，將士們無不痛哭失聲。
後祖大壽聽從袁崇煥勸阻，回師關內，痛擊清軍，一連收複數城。
魏忠賢餘黨在袁崇煥入獄後，多次上疏，以「擅主議和」之罪殺袁崇煥，朝內上下，竟然沒有一個人出來為袁崇煥說話。1830年8月16日，崇禎以「謀叛欺君」之罪，將袁崇煥分屍（處以磔刑），並暴屍街頭。其妻子兄弟皆流放。抄家時，袁家上下，幾乎沒有餘物。
計除袁崇煥後，皇太極接連獲得大凌河、松山等戰役大捷，徹底摧毀了明軍的防禦體系，為消滅明軍掃平了道路。
袁崇煥死後，這大明的人都認為袁崇煥是個漢奸，他的死是罪有應得。「
」只有皇上自己知道，這袁崇煥乃是一代愛國名將，竟死於皇上的間諜戰，對他本人來說也真是千古奇冤。「
「皇上此招，把孫子兵法用的爐火純情，臣自愧不如也」。
英格利最後終結道。
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