帝國內部一個人可能利用假肢和機械器官替代受損或損壞的身體部件，或者只是為了提高自己的能力。機械神教仿生學的改造內容包括：身體部位，大腦植入物，控制性武器以及其他部分的替代設備乃至整個身體的替換。帝國沒有仿生技術的固定標準，其改造水平也是參差不齊-許多仿生學是拙劣的和低效的替代，而最好的改造能夠達到完美的複製，甚至大幅提高原有肢體或器官的性能。
機械神教為帝國審判庭提供的仿生學較為複雜的，它們擁有可以扭轉死亡或癱瘓的方式。
在大多數帝國衛隊團，只有部分人員可以獲得仿生設備。另一方面，有的帝國衛隊團甚至可以讓每一個士兵都接受改造，從而使軍隊戰鬥力得到極大的加強。此外，鋼鐵之手戰團是機械改造技術的著名使用者，他們竭盡全力改造自己的**，使之機械化，以便消除**的弱點。事實上，在一些有資格使用帝國仿生學的組織機構，幾乎所有人都有可能接受機械化改造。即使是一些富裕的帝國公民，只要有足夠的錢，也可以接受機械化改造。
雖然大多數仿生機械零件都是稀鬆平常的身體器官的替代品，例如許多人使用的人造血管，人造神經末梢等（它們通常用於替代受損的身體部分），但是一般的機械仿生結構依舊擁有大大超越原有普通身體結構的特殊能力，其具體類別主要有以下幾種：
仿生器官
富人或特權階層是其主要消費者，機械化改造可以代替患病或年老的器官，因此提供了一個增加壽命的方法。幾乎所有器官可以更換，甚至部分大腦也可以更換。最簡單的是單純的替代品，而更先進改造技術則可以在原有基礎上增加一些功能或者使器官擁有超出其原有效果的能力（相當於器官能力增幅技術，可以讓你一跳百丈高，輕功水上漂）。
仿生感官
帝國的這種技術是通過模仿感官能力，從而達到代替眼睛，耳朵，鼻子的某些部分的能力，甚至是觸摸和品嘗的效果。更先進的仿生感覺甚至可以產生共感覺的效果（看過canaan的都知道什麼是共感覺吧，就是你可以聽見顏色，看見氣味，嘗到聲音）。
仿生眼可以增加主體的視覺頻譜，使你能夠看到熱量，以及可以鎖定視覺和抵抗閃光致盲的影響。機械眼武器也不是什麼困難的技術（參考雅叔），改造聽覺可以提高聽力至超越正常水平的地步，使用者可以聽到的生物呼吸，心臟跳動。
植入結構
植入物有各種形狀和大小，例如為大腦植入防護設備和存儲器。一些比較深奧的改造結構將在下面列出。機械神甫們是最為著名的植入結構使用者群體，他們的身體擁有更多的植入部分，他們設計了一些特殊的植入結構，這個列表並不詳盡:
帕普西-輔助裝置
心靈輔助裝置能增加大腦的控制能力，它負責精神的一部分活動，它擁有控制比使用者的裝置級別更低者的精神的能力（就是局長可以控制處長，處長又可以控制科長，以此類推，相當於尤里的精神控制，只不過是分級別的，級別越高，控制別人能力越強）
心靈脈衝單元
心靈衝動單元是生命體的大腦和一台設備的神經聯繫，使個人，控制和監測系統的行動達到協調一致。這種技術最常用到的地方是無畏機甲和機械神教巨大的泰坦。在其他地方，它的主要用途是在手臂上安裝武器，而最實際的應用之一，是允許使用者安裝武器的同時保持雙手可以自由活動。在一些無法安裝武器的特殊情況下，為了設備能正常運作，它能讓使用者在身體內部控制這些武器，提高武器的可操控性，使用者必須非常小心，以防止燒壞自己的大腦。心靈遙控設備也是存在的，雖然它很罕見，它通常用於控制機械設備或某些類型的僕人，這種技術可以解決一些棘手的問題，例如使用者無法完成某些工作時（可能是因為工作地點人類難以適應或者該地點太過龐大等），這種技術就被派上了用場，。
植入武器
植入武器是將現有肢體移除，拆卸掉手或整個手臂（拆掉整個手臂的情況比較少），用一個比一個更複雜的設備替代之。它可以提高武器的操縱性，但是大大削弱了手或手臂除移植部分外其他的戰鬥功能（例如你把手改造成一支電漿槍，就沒辦法再用鏈鋸劍了）。因此，這種仿生不是特別實用，通常是為了起到恐嚇的目的，這種技術的使用者接受的移植手術往往非常粗糙，通常會留下可怕的縫合疤痕，植入物也是超出自身身體素質所能承受的範圍。另一個在身體上植入武器的原因是原先的先天條件不足，使用者需要擔負某些特定職責，所以不得不在體內植入武器，例如角鬥士（40k版斯巴達克斯，安格郎）和戰鬥奴工
mechadendrites
mechadendrites由機械神教用於幫助製造和建設，維護他們的機械卷鬚和輔助研究。這些機械改造被用於在其武器和身體裝甲上，它幾乎是他們自己的生命小型電機和驅動器。
電路網（electoos）
電路網是利用金屬條引導電能的特殊植入結構，它的使用數量有限;一個極端的例子是著名的電牧師，他們依靠自己劈啪作響的高壓電弧進行戰鬥，電路網的使用者能夠直接吸收設備或電源供電，然後駕馭利用這些電能，有時會造成災難性後果。
反向思維
甚至在一些激進派系中間，它也被認為是極端措施。通過將創意，情緒，不合邏輯的大腦右半球摘除，然後用充滿邏輯的左腦取而代之，接受這項改造的人，將是一位絕對理性的人。
